A disposição do site referenciando.com contém 6 partes distintas (veja a figura abaixo):

1. Menu Horizontal: Links para as páginas operacionais e de suporte do site: página inicial, página de entrada das referências e conteúdo, página de contato, página com informações sobre o autor e sobre o site, esta página de ajuda e finalmente um link para uma página explicando como você pode colaborar com o site.

2. Caminho do Artigo: Este é um caminho indicativo de onde o usuário está em relação à página inicial. Este caminho contém todas as categorias e sub-categorias que levam da página de entrada do site (início) até o artigo sendo apresentado. Se o usuário clicar em um dos elementos do caminho ele será levado diretamente para a página daquela sub-categoria.
3. Campo de Busca: O site provê um mecanismo de busca para permitir que usuários encontrem artigos com base em palavras-chave especificadas no campo de busca.
4. Menu Vertical: Este é o menu principal de navegação, permitindo ao usuário selecionar categorias, sub-categorias e artigos. Note que se uma categoria contendo diversos artigos for selecionado, links para todos os artigos dentro daquela categoria serão mostrados logo abaixo no menu. Veja a figura ao lado, neste exemplo a sub-categoria é 'Tags' e todos os artigos nesta sub-categoria são mostrados abaixo.

Note que ao lado de cada opção do meu é apresentado um indicador. A seta apontando para baixo indica que o link representa uma categoria contendo outras sub-categorias ou artigos. No exemplo da figura ao lado, 'Referências' é a categoria principal. 'HTML / XHTML' é uma sub-categoria de 'Referências' e que contém uma outra sub-categoria de nome 'Tags'. Este último por sua vez contém os artigos '<!--...-->', etc.. A seta apontando para a direita indica a sub-categoria ou artigo selecionado no momento e cujo conteúdo é apresentado na área de conteúdo (elemento número 5).

É importante lembrar que o menu vertical lista apenas as categorias, sub-categorias ou artigos imediatamente anteriores e posteriores ao item selecionado. Categorias e artigos que não estejam em linha direta com o artigo selecionado não são apresentados no menu. Este comportamento é necessário devido ao potencial número de categorias, sub-categorias e artigos publicados no site. No exemplo ao lado, o artigo selecionado é '<!DOCTYPE>'. Se o usuário clicar em 'HTML / XHTML'  todas as sub-categorias deste serão apresentadas, isto é: 'Tags', 'Eventos', 'Atributos', etc., permindo a navegação por todos os artigos daquela categoria.

5. Conteúdo: Nesta área é apresentado o conteúdo do artigo ou da página selecionada.
6. Rodapé: Além da autoria e versão do programa de gerenciamento do site, aqui o usuário também encontra a data da última atualização do artigo ou da página sendo mostrada no formato ISO, isto é: ANO-MÊS-DIA HORA:MINUTO:SEGUNDO.